MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Glaciecola nitratireducens FR1064 chromosome

Total Repeats: 80725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016041	AGA	2	6	35	40	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
2	NC_016041	CAA	2	6	118	123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027468
3	NC_016041	TTA	3	9	214	222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027468
4	NC_016041	AAC	2	6	252	257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027468
5	NC_016041	GCA	2	6	260	265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027468
6	NC_016041	AAC	2	6	294	299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027468
7	NC_016041	AGAT	2	8	308	315	50 %	25 %	25 %	0 %	348027468
8	NC_016041	AACAA	2	10	364	373	80 %	0 %	0 %	20 %	348027468
9	NC_016041	ACA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027468
10	NC_016041	TGG	2	6	419	424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027468
11	NC_016041	ACG	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027468
12	NC_016041	TAA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
13	NC_016041	CTA	2	6	577	582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027468
14	NC_016041	GGT	2	6	609	614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027468
15	NC_016041	AGC	2	6	634	639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027468
16	NC_016041	GCTC	2	8	648	655	0 %	25 %	25 %	50 %	348027468
17	NC_016041	TGG	2	6	668	673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027468
18	NC_016041	TCA	2	6	692	697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027468
19	NC_016041	AAG	2	6	703	708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
20	NC_016041	AAT	2	6	732	737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
21	NC_016041	TTG	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027468
22	NC_016041	TAA	2	6	902	907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
23	NC_016041	TGG	2	6	941	946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027468
24	NC_016041	TAA	2	6	1001	1006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
25	NC_016041	AGA	2	6	1085	1090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
26	NC_016041	TCGG	2	8	1106	1113	0 %	25 %	50 %	25 %	348027468
27	NC_016041	CTG	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027468
28	NC_016041	AAG	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
29	NC_016041	T	6	6	1176	1181	0 %	100 %	0 %	0 %	348027468
30	NC_016041	ATT	2	6	1218	1223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027468
31	NC_016041	GTT	2	6	1302	1307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027468
32	NC_016041	CCT	2	6	1314	1319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	348027468
33	NC_016041	TGA	2	6	1345	1350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027468
34	NC_016041	AGTT	2	8	1543	1550	25 %	50 %	25 %	0 %	348027468
35	NC_016041	ATT	2	6	1582	1587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027468
36	NC_016041	GTT	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027468
37	NC_016041	AGA	2	6	1793	1798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027468
38	NC_016041	TAA	2	6	1810	1815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
39	NC_016041	TAA	2	6	1830	1835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027468
40	NC_016041	ACGAG	2	10	1841	1850	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016041	TTA	2	6	1882	1887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
42	NC_016041	ACG	2	6	1920	1925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027469
43	NC_016041	CA	3	6	1927	1932	50 %	0 %	0 %	50 %	348027469
44	NC_016041	A	6	6	2071	2076	100 %	0 %	0 %	0 %	348027469
45	NC_016041	ATC	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027469
46	NC_016041	GCGA	2	8	2191	2198	25 %	0 %	50 %	25 %	348027469
47	NC_016041	A	6	6	2273	2278	100 %	0 %	0 %	0 %	348027469
48	NC_016041	GCA	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027469
49	NC_016041	TTA	2	6	2310	2315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
50	NC_016041	GAA	2	6	2341	2346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027469
51	NC_016041	TTA	2	6	2351	2356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
52	NC_016041	GCT	2	6	2410	2415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027469
53	NC_016041	GC	3	6	2425	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	348027469
54	NC_016041	TTA	2	6	2435	2440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
55	NC_016041	AAT	2	6	2463	2468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027469
56	NC_016041	GTA	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027469
57	NC_016041	AGA	2	6	2590	2595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027469
58	NC_016041	CG	3	6	2633	2638	0 %	0 %	50 %	50 %	348027469
59	NC_016041	AGAGCA	2	12	2748	2759	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	348027469
60	NC_016041	TAG	2	6	2771	2776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027469
61	NC_016041	CTTAT	2	10	2822	2831	20 %	60 %	0 %	20 %	348027469
62	NC_016041	TCA	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027469
63	NC_016041	ATT	3	9	2958	2966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027469
64	NC_016041	ATCT	2	8	2991	2998	25 %	50 %	0 %	25 %	348027470
65	NC_016041	ATC	2	6	3065	3070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027470
66	NC_016041	ATC	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027470
67	NC_016041	AC	3	6	3172	3177	50 %	0 %	0 %	50 %	348027470
68	NC_016041	TTGA	2	8	3206	3213	25 %	50 %	25 %	0 %	348027470
69	NC_016041	A	6	6	3231	3236	100 %	0 %	0 %	0 %	348027470
70	NC_016041	GA	4	8	3285	3292	50 %	0 %	50 %	0 %	348027470
71	NC_016041	AAG	2	6	3296	3301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027470
72	NC_016041	AGT	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027470
73	NC_016041	TTG	2	6	3393	3398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027470
74	NC_016041	CT	3	6	3461	3466	0 %	50 %	0 %	50 %	348027470
75	NC_016041	ATT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027470
76	NC_016041	GCA	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027470
77	NC_016041	AGT	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027470
78	NC_016041	CTGG	2	8	3672	3679	0 %	25 %	50 %	25 %	348027470
79	NC_016041	AGA	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027470
80	NC_016041	TTC	2	6	3874	3879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027470
81	NC_016041	CTAT	2	8	3897	3904	25 %	50 %	0 %	25 %	348027470
82	NC_016041	TGA	2	6	3910	3915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027470
83	NC_016041	T	6	6	3952	3957	0 %	100 %	0 %	0 %	348027470
84	NC_016041	AAAT	2	8	4027	4034	75 %	25 %	0 %	0 %	348027470
85	NC_016041	A	6	6	4043	4048	100 %	0 %	0 %	0 %	348027470
86	NC_016041	GAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348027470
87	NC_016041	A	6	6	4086	4091	100 %	0 %	0 %	0 %	348027470
88	NC_016041	AGA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
89	NC_016041	TTC	2	6	4111	4116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027471
90	NC_016041	GTT	2	6	4220	4225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027471
91	NC_016041	TGA	2	6	4237	4242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027471
92	NC_016041	GAA	3	9	4343	4351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
93	NC_016041	CAG	2	6	4359	4364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027471
94	NC_016041	TTA	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
95	NC_016041	A	7	7	4474	4480	100 %	0 %	0 %	0 %	348027471
96	NC_016041	CGT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027471
97	NC_016041	ACA	2	6	4586	4591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027471
98	NC_016041	GAA	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
99	NC_016041	ATC	2	6	4697	4702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027471
100	NC_016041	CAA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027471
101	NC_016041	AGT	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027471
102	NC_016041	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027471
103	NC_016041	TGG	2	6	4924	4929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027471
104	NC_016041	AAG	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
105	NC_016041	GCG	2	6	5025	5030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348027471
106	NC_016041	ACG	2	6	5031	5036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027471
107	NC_016041	TCA	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027471
108	NC_016041	TCT	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027471
109	NC_016041	GAAGT	2	10	5123	5132	40 %	20 %	40 %	0 %	348027471
110	NC_016041	AAC	2	6	5157	5162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027471
111	NC_016041	ACT	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027471
112	NC_016041	TTG	2	6	5205	5210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027471
113	NC_016041	ATT	2	6	5216	5221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
114	NC_016041	CG	3	6	5245	5250	0 %	0 %	50 %	50 %	348027471
115	NC_016041	TA	4	8	5352	5359	50 %	50 %	0 %	0 %	348027471
116	NC_016041	CTG	2	6	5373	5378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027471
117	NC_016041	A	6	6	5407	5412	100 %	0 %	0 %	0 %	348027471
118	NC_016041	TCT	2	6	5480	5485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027471
119	NC_016041	AAG	2	6	5487	5492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
120	NC_016041	TTA	2	6	5502	5507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
121	NC_016041	ATT	3	9	5570	5578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
122	NC_016041	CTGATG	2	12	5583	5594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	348027471
123	NC_016041	TTC	3	9	5630	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027471
124	NC_016041	TTGA	2	8	5654	5661	25 %	50 %	25 %	0 %	348027471
125	NC_016041	TTATAT	2	12	5668	5679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
126	NC_016041	CCG	2	6	5687	5692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348027471
127	NC_016041	AAAG	2	8	5704	5711	75 %	0 %	25 %	0 %	348027471
128	NC_016041	GAT	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027471
129	NC_016041	TTA	2	6	5757	5762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
130	NC_016041	AG	3	6	5819	5824	50 %	0 %	50 %	0 %	348027471
131	NC_016041	CAG	2	6	5875	5880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027471
132	NC_016041	AGA	2	6	5888	5893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
133	NC_016041	GAAC	2	8	6067	6074	50 %	0 %	25 %	25 %	348027471
134	NC_016041	GAA	2	6	6194	6199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
135	NC_016041	GTG	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027471
136	NC_016041	GAA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
137	NC_016041	TTTGG	2	10	6256	6265	0 %	60 %	40 %	0 %	348027471
138	NC_016041	AAG	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027471
139	NC_016041	AGC	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027471
140	NC_016041	AGC	2	6	6333	6338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027471
141	NC_016041	ATT	2	6	6415	6420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027471
142	NC_016041	TTA	2	6	6507	6512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016041	TGA	3	9	6549	6557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016041	T	7	7	6563	6569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016041	CTAC	2	8	6581	6588	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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148	NC_016041	ATA	3	9	6691	6699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016041	TCT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016041	GCC	2	6	6909	6914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_016041	ATC	2	6	6923	6928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_016041	TGAT	2	8	7022	7029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016041	TGGTTT	2	12	7033	7044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027472
154	NC_016041	ACA	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027472
155	NC_016041	GCAT	2	8	7137	7144	25 %	25 %	25 %	25 %	348027472
156	NC_016041	ACTA	2	8	7161	7168	50 %	25 %	0 %	25 %	348027473
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159	NC_016041	ATT	2	6	7296	7301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027473
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161	NC_016041	AAACAT	2	12	7320	7331	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	348027474
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174	NC_016041	GTTT	2	8	8051	8058	0 %	75 %	25 %	0 %	348027475
175	NC_016041	GC	3	6	8115	8120	0 %	0 %	50 %	50 %	348027475
176	NC_016041	GTT	2	6	8137	8142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027475
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232	NC_016041	TG	3	6	10980	10985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
233	NC_016041	ATT	2	6	10988	10993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_016041	A	6	6	11199	11204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_016041	TTGT	2	8	11264	11271	0 %	75 %	25 %	0 %	348027477
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252	NC_016041	TTG	2	6	12000	12005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
253	NC_016041	AATT	2	8	12015	12022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_016041	TCT	2	6	12063	12068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027478
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261	NC_016041	AAT	3	9	12431	12439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027478
262	NC_016041	ATC	2	6	12532	12537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027479
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265	NC_016041	AGC	2	6	12662	12667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027479
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267	NC_016041	GCA	2	6	12768	12773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027479
268	NC_016041	TAC	2	6	12789	12794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027479
269	NC_016041	T	6	6	12808	12813	0 %	100 %	0 %	0 %	348027479
270	NC_016041	TTTC	2	8	12880	12887	0 %	75 %	0 %	25 %	348027479
271	NC_016041	GTAC	2	8	12905	12912	25 %	25 %	25 %	25 %	348027479
272	NC_016041	T	6	6	12961	12966	0 %	100 %	0 %	0 %	348027479
273	NC_016041	TGC	2	6	12990	12995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_016041	TAT	2	6	13072	13077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_016041	T	6	6	13137	13142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_016041	ATTT	2	8	13171	13178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_016041	TAA	2	6	13183	13188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_016041	TAA	2	6	13209	13214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_016041	AGA	2	6	13229	13234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_016041	A	6	6	13277	13282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016041	TTAAT	2	10	13305	13314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016041	CAT	2	6	13347	13352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_016041	TGT	2	6	13359	13364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_016041	TAT	3	9	13388	13396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016041	TAT	3	9	13441	13449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016041	ATA	2	6	13527	13532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_016041	T	6	6	13556	13561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_016041	TTTA	3	12	13573	13584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_016041	ATA	2	6	13613	13618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027480
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312	NC_016041	TTTA	2	8	14388	14395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_016041	TATTT	2	10	18532	18541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_016041	A	6	6	18566	18571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
390	NC_016041	GAGC	2	8	18611	18618	25 %	0 %	50 %	25 %	348027483
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397	NC_016041	ATA	2	6	18823	18828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_016041	TAA	2	6	18835	18840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_016041	CAT	2	6	18874	18879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027484
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401	NC_016041	GAT	2	6	18919	18924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027484
402	NC_016041	CGC	2	6	19031	19036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348027484
403	NC_016041	GTTTT	2	10	19079	19088	0 %	80 %	20 %	0 %	348027484
404	NC_016041	CGT	2	6	19101	19106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027484
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426	NC_016041	TTA	2	6	20326	20331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_016041	TTGG	2	8	20371	20378	0 %	50 %	50 %	0 %	348027485
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